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PlantScreen植物表型應(yīng)用——高通量種子萌發(fā)活力與表型監(jiān)測
發(fā)布時(shí)間: 2020-03-12 點(diǎn)擊次數(shù): 2410次種子活力是種子發(fā)芽和出苗率、幼苗生長的潛勢、植株抗逆能力和生產(chǎn)潛力的總和(發(fā)芽和出苗期間的活性水平與行為),是種子品質(zhì)的重要指標(biāo),具體包括吸漲后旺盛的代謝強(qiáng)度、出苗能力、抗逆性、發(fā)芽速度及同步性、幼苗發(fā)育與產(chǎn)量潛力。
種子萌發(fā)實(shí)驗(yàn)無疑是直接有效的種子活力檢測方法。但一般的傳統(tǒng)方法需要人工計(jì)數(shù)來測量幼苗和計(jì)算發(fā)芽率,工作量極大,也非常耗時(shí)。而基于彩色圖像分析來識別發(fā)芽幼苗又存在很大誤差。
同時(shí),傳統(tǒng)的形態(tài)數(shù)據(jù)難以真正評估幼苗生長的潛勢、植株抗逆能力和生產(chǎn)潛力。因此,基于現(xiàn)代植物表型組學(xué)研究和種子活力評估要求,在種子萌發(fā)實(shí)驗(yàn)中還需要實(shí)時(shí)監(jiān)測各種表型數(shù)據(jù),而不僅僅是傳統(tǒng)表型所說的形態(tài)數(shù)據(jù)。
赫爾辛基大學(xué)的研究人員為了研究一種新的ABA響應(yīng)泛素E3連接酶對擬南芥種子萌發(fā)活力的影響,設(shè)計(jì)了一個(gè)基于高通量葉綠素?zé)晒獬上穹治龅拿劝l(fā)實(shí)驗(yàn)。這一實(shí)驗(yàn)主要通過赫爾辛基大學(xué)國家植物表型研究設(shè)施(National Plant Phenotyping Infrastructure,NaPPI)中裝備的PlantScreen植物表型成像分析系統(tǒng)完成的。
赫爾辛基大學(xué)裝備的兩套PlantScreen植物表型成像分析系統(tǒng):一套適用于50cm以下的小型植株,如擬南芥或作物幼苗等(上圖);一套適用于120cm以下的大型植株,如小麥、玉米等(下圖)
PlantScreen植物表型成像分析系統(tǒng)可以自動對植物樣品進(jìn)行連續(xù)培養(yǎng)和表型監(jiān)測,非常適用于進(jìn)行高通量的種子萌發(fā)實(shí)驗(yàn)。其配備的LED光照控溫培養(yǎng)室能夠模擬理想的光照與溫度條件。自動傳送系統(tǒng)可以按設(shè)置的序列自動讓樣品傳送到成像室。內(nèi)置的FluorCam葉綠素?zé)晒獬上衲K可以通過監(jiān)測種子萌發(fā)后剛展開子葉的大熒光值Fm,非常有效地識別發(fā)芽的種子。的分析軟件能夠很容易地將未萌發(fā)種子和背景去除掉,從而使發(fā)芽率計(jì)算極為準(zhǔn)確。
高通量葉綠素?zé)晒獬上穹治龉ぷ髁鞒?/span>;a.播種、放置樣品、成像測量、圖像分析;b.大葉綠素?zé)晒釬m成像圖的分析過程
葉綠素?zé)晒獬上穹治龊蟪四塬@得準(zhǔn)確的動態(tài)發(fā)芽率曲線,還可以同時(shí)獲得一系列與植物光合能力、抗性相關(guān)的表型動態(tài)曲線,如葉綠素?zé)晒鈪?shù)、冠層面積等。葉綠素?zé)晒鈪?shù),例如QY_max大光化學(xué)效率(Fv/Fm,對各種脅迫極為敏感)、Effective QY實(shí)際光化學(xué)效率(量子產(chǎn)額)、NPQ非光化學(xué)淬滅(與光系統(tǒng)熱耗散、光保護(hù)機(jī)制有關(guān))、Rfd熒光衰減比率等可以反映植物光合能力和光系統(tǒng)抗逆能力。PlantScreen配備的熱成像單元還可以提供冠層和葉片溫度數(shù)據(jù),反映植物蒸騰、水分利用狀態(tài)以及病害等脅迫信息。這些指標(biāo)已經(jīng)廣泛用于幼苗生長潛勢、植株抗逆能力和生產(chǎn)潛力的評估,并得到了大量的驗(yàn)證。
左:發(fā)芽率動態(tài)曲線;右:冠層投影面積、各項(xiàng)葉綠素?zé)晒鈪?shù)、冠層溫度的動態(tài)曲線
因?yàn)楦鞣N原因,無法使用PlantScreen植物表型成像分析系統(tǒng)進(jìn)行種子萌發(fā)活力實(shí)驗(yàn)的科學(xué)家,也可以選擇PhenoTron作物種質(zhì)資源監(jiān)測鑒定平臺。這一平臺包括LED光照培養(yǎng)箱、FluorCam葉綠素?zé)晒獬上瘛⒎N子形態(tài)分析、種子代謝強(qiáng)度測量、高光譜成像、熱成像等儀器系統(tǒng),可根據(jù)具體研究需要靈活組合、定制設(shè)計(jì)。
參考文獻(xiàn):
Pavicic M, et al. 2019. High throughput in vitro seed germination screen identifed new ABA responsive RING?type ubiquitin E3 ligases in Arabidopsis thaliana. Plant Cell, Tissue and Organ Culture 139: 563-575